轉(zhuǎn)錄組學(xué)
transcriptomics
定義:在整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律。
學(xué)科:醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)_醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)基礎(chǔ)_總論
相關(guān)名詞:RNA 測序技術(shù) 基因表達(dá)
圖片來源:視覺中國
【延伸閱讀】
轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一門研究基因表達(dá)的科學(xué),主要關(guān)注基因從DNA到RNA轉(zhuǎn)錄過程以及RNA的處理并最終表達(dá)為蛋白質(zhì)的過程。通過對轉(zhuǎn)錄組的分析,可以了解哪些基因在什么時(shí)候被激活,它們的表達(dá)水平如何變化。轉(zhuǎn)錄組學(xué)對于研究疾病的發(fā)生和發(fā)展,以及開發(fā)新的藥物和治療方法具有重要意義。
轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展可以追溯到20世紀(jì)90年代的基因組學(xué)時(shí)代。隨著生物技術(shù)的飛速發(fā)展,科學(xué)家們開發(fā)出了一系列技術(shù),如芯片技術(shù)和高通量測序技術(shù),以快速、高效地研究基因轉(zhuǎn)錄的相關(guān)信息。獲得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的常見方法包括:
1.轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq):利用高通量測序技術(shù)對RNA樣本進(jìn)行測序,獲得高分辨率、全面的RNA序列信息。對所獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾、比對、定量和注釋等一系列處理,最終得到具有生物學(xué)意義的結(jié)果。目前,轉(zhuǎn)錄組測序是最常用的獲得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的方法。
2.微陣列(microarray):一種利用核酸微陣列技術(shù)檢測RNA水平的方法,可以同時(shí)檢測數(shù)千個(gè)基因的表達(dá)水平。
3.RT-qPCR:一種定量PCR技術(shù),可以用于檢測特定基因的表達(dá)水平。
4.單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組:一種新興的轉(zhuǎn)錄組技術(shù),可以檢測每個(gè)單個(gè)細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄組。
轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一門非常重要的科學(xué),其應(yīng)用領(lǐng)域非常廣泛。其中,最常見的應(yīng)用領(lǐng)域包括疾病診斷和預(yù)防、藥物研發(fā)、農(nóng)業(yè)生物技術(shù)和生態(tài)學(xué)研究。轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以幫助研究人員了解基因表達(dá)的模式,從而更好地預(yù)防和治療疾病。它還可以用于開發(fā)新的藥物,以治療各種疾病。此外,轉(zhuǎn)錄組學(xué)也可以用于改良作物,以提高農(nóng)業(yè)生產(chǎn)率。在未來,轉(zhuǎn)錄組學(xué)還可以與其他組學(xué)一起多組學(xué)分析,從不同層面獲取數(shù)據(jù),為解釋生命現(xiàn)象提供更多證據(jù),從而更加深入了解復(fù)雜的分子機(jī)制。
(延伸閱讀作者:東北師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 李寧博士)
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